長(cháng)江口航道建設有限公司負責長(cháng)江航道瀏河口至長(cháng)江入?？诩s122公里河段的規劃、管理、建設、維護和科研工作。管理局是交通運輸部所屬正局級公益事業(yè)單位。局機關(guān)設8個(gè)職能處室和一個(gè)內設機構（長(cháng)江口航道養護中心，正處級），下屬1個(gè)二級單位——上海河口海岸科學(xué)研究中心，為副局級科研事業(yè)單位。